Los orígenes del Municipio de Ensenada, tierra nueva y de profundo horizonte histórico, tierra de retos y esperanza, se remontan muchos años antes de la llegada de los españoles; luminosas y evocadoras son las historias y leyendas que rodean los inicios de la Ensenada de Todos Santos, desconociéndose los orígenes de las razas aborígenes que poblaron la región.

Actualmente de los cinco grupos indígenas que aún subsisten en el estado, cuatro se localizan en el municipio de Ensenada.

1. CUCAPÁ: Sur del Valle de Mexicali, El Mayor Cucapá, Colonia Carranza, Laguna Salada.
2. KILIWA: En el Valle de La Trinidad, Arroyo León.
3. KUMIAI: San José de la Zorra, Juntas del Neji, San José de Tecate.
4. PA'IPAI: San Isidoro, Santa Catarina, Cañón de los Encinos, Jamau.
5. COCHIMI: Valle de Ojos Negros, La Huerta, San Antonio Necua.

17 de Septiembre de 1542.- El explorador portugués Juan Rodríguez Cabrillo, a nombre de la corona española, descubre la actual Bahía de Ensenada, a la cual llamó Bahía de San Mateo.

2 de Noviembre de 1602.- Llega a la bahía el Capitán Sebastián Vizcaíno, renombrándola Bahía de Todos Santos.

1805.- El Alférez José Manuel Ruíz, recibe como compensación a sus servicios como militar y gobernante, dos sitios de ganado mayor, conocido como rancho Ensenada de Todos Santos, fundándose así, lo que es ahora la ciudad de Ensenada.

4 de Octubre de 1824.- Se reconoce en la Constitución Federal de 1824 los dos territorios: el de la Alta y la Baja California.

Agosto de 1856-1860.- Se establece en Real del Castillo la comandancia del Partido Norte del territorio de la Baja California.

1872.- Real del castillo es nombrada capital del territorio de Baja California.

15 de Mayo de 1882.- El Presidente de la República, General Porfirio Díaz, declara que la cabecera del Partido Norte cambiaría del Real del Castillo a Ensenada de Todos Santos, fecha que se considera como oficial de la fundación de Ensenada.

15 de Diciembre de 1887.- El gobierno declara que la península de Baja California, queda dividida en dos partidos políticos, denominados distritos (norte y sur), con residencia en Ensenada de Todos Santos y La Paz respectivamente.

1915.- Ensenada deja de ser cabecera municipal del distrito norte, la cual es trasladada a Mexicali por instrucciones del coronel Esteban Cantú.

1930.- Los distritos norte y sur de la Baja California cambian a territorios, quedando constituido el Territorio Norte por tres delegaciones: Mexicali, Tijuana y Ensenada.

16 de Enero de 1952.- Se publica el decreto presidencial del 31 de Diciembre de 1951, donde Baja California deja de ser territorio y se convierte en el Estado 29 de la República Mexicana, integrándose con 4 municipios: Mexicali, Tecate, Tijuana y Ensenada.